WP3 Promovenda Karla Muller ontving de ISME-reisbeurs en de UvA-promovendreisbeurs om in augustus 2026 (16-21) het ISME20 (International Symposium on Microbial Ecology) in Auckland, Nieuw-Zeeland, bij te wonen. Ze presenteerde haar onderzoek via een posterpresentatie met de titel: Verloren potentieel: Is het bestuderen van de potentiële functionele trends van het microbioom van zuigelingen de sleutel tot het begrijpen van de eco-evolutionaire processen die de ontwikkeling bepalen?
“De eerste duizend dagen van de ontwikkeling van het microbioom van zuigelingen zijn cruciaal voor de gezondheid op de lange termijn, en verstoringen tijdens deze kritieke periode zijn in verband gebracht met diverse ziekten. Het is belangrijk om een mechanistisch inzicht te krijgen in de factoren die veranderingen in het microbioom in de loop van de tijd aansturen, als basis voor het verbeteren van toekomstige interventies in de gezondheidszorg. De dynamiek van het microbioom vloeit voort uit het complexe samenspel tussen ecologische en evolutionaire processen, die zich op dezelfde tijdschaal afspelen en elkaar wederzijds beïnvloeden. Dit maakt het notoir uitdagend om de exacte mechanismen te begrijpen die veranderingen in het microbioom in de loop van de tijd aansturen.
Het merendeel van het microbioomonderzoek richt zich op verschuivingen in de taxonomische samenstelling, maar recent onderzoek heeft het belang van het functionele potentieel benadrukt. In deze studie streven we ernaar het functionele potentieel van het zich ontwikkelende darmmicrobioom bij zuigelingen te karakteriseren. Daartoe hebben we meerdere longitudinale studies samengevoegd, die een brede geografische spreiding bestrijken en variëren wat betreft bevallingswijze, voedingsmethoden en de gezondheidstoestand van de zuigelingen. Met behulp van metagenomica en geavanceerde instrumenten voor vergelijkende genomica karakteriseren we verschuivingen in zowel functionele als taxonomische profielen.
Functionele profilering laat bijvoorbeeld zien dat microbioomprofielen van zuigelingen sterk kunnen verschillen in hun metabolische onafhankelijkheid en in de aanwezigheid van bepaalde metabolische modules. Deze studie levert nieuwe en waardevolle inzichten op in de processen die het microbioom van zuigelingen vormgeven, die verder gaan dan taxonomische classificatie. Toekomstig onderzoek zal de waargenomen trends in functionele profielen integreren met nieuwe instrumenten voor het volgen van stammen en eco-evolutionaire modellen, om zo een mechanistisch en functioneel inzicht te verkrijgen in de eco-evolutionaire processen die de dynamiek van het microbioom van zuigelingen gedurende de eerste drie levensjaren bepalen.”

Karla voor haar poster