Werkpakket 4
Microbioommodulatie in vitro
Algemeen doel
Het ontwikkelen en valideren van in-vitromodellen voor gastheer-microbioom interacties (HMI) die gebruikt kunnen worden om de impact te voorspellen van interventies op de fysiologische balans tussen de gastheer en zijn microben in de mondholte en in de darmen als de belangrijkste arena’s voor de wisselwerking tussen de gastheer, zijn microbioom en voeding.
Doelstellingen
- Het ontwikkelen van een HMI-model in de mondholte en darmholte waarmee microbiële en gastheerbijdragen aan de homeostase kunnen worden geanalyseerd en mechanismen kunnen worden bestudeerd die betrokken zijn bij het handhaven van de homeostase.
- Het beschrijven van de immuun fitness in in vitro HMI modellen.
- Het effect evalueren van microbieel afgeleide metabolieten, met name vetzuren met een korte keten, op de immuun fitness in HMI modellen.
- De rol van bekende variaties in voedingsvezels, oligosacchariden, pre- en probiotica in de orale en darm HMI bestuderen.
- Assisteren bij in silico modellering (WP3) in verschillende stadia van het WP door iteratieve cycli van in vitro en in silico modellering van vaste variabelen.
- Het vertalen van aangewezen interventies (WP5) in testbare variabelen in in vitro HMI modellen en het voorspellen van hun waarde in het versterken van de orale en darm homeostase in de eerste 1000 dagen.
- Het verspreiden van bereikte output tijdens en aan het einde van het werkpakket.
Actieve periode
Jaar 3-8
Leden van WP4
Betrokken consortiumpartners
ACTA, AUMC/Tytgat, WUR, UvA-SILS.
Samenwerkingspartners/ co-financiers
NIBI, Bètapartners, BaseClear.
Voortgang
In 2024 is het inhuren van wetenschappelijk talent afgerond (drie PhD posities (waarvan een gedeeld met WP3). Ook organiseerden we een startbijeenkomst (15 april 2024) om het werkpakket af te stemmen op het hele project en op de huidige stand van de wetenschap.
WP4 is direct op 1 januari 2025 gestart.